COVIDSeq Assay，產(chǎn)品編號(hào)：20049393。

這種低到中等通量的 NGS 檢測(cè)使實(shí)驗(yàn)室能夠識(shí)別和跟蹤新型 SARS-CoV-2 毒株的出現(xiàn)和流行。

COVIDSeq Assay，主要特點(diǎn)和優(yōu)勢(shì)：

• 準(zhǔn)確：檢測(cè) SARS-CoV-2 RNA 上的 98 個(gè)目標(biāo)，以高度準(zhǔn)確地檢測(cè)突變

• 全面：當(dāng)檢測(cè)到 +90 個(gè)擴(kuò)增子時(shí)報(bào)告共有序列

• 質(zhì)量控制：每個(gè)反應(yīng)的內(nèi)置質(zhì)量控制

• 靈活：無縫的端到端工作流程；溫度規(guī)格允許使用不同的熱循環(huán)儀

這種基于擴(kuò)增子的下一代測(cè)序 (NGS) 檢測(cè)旨在幫助臨床研究實(shí)驗(yàn)室識(shí)別新型 SARS-CoV-2 毒株。用于檢測(cè) SARS-CoV-2 病毒的突變和表征 RNA。

快速、低通量的 SARS-CoV-2 檢測(cè)，Illumina COVIDSeq Assay 可容納少量樣本。該工作流程包括病毒 RNA 提取、RNA 到 cDNA 轉(zhuǎn)換、PCR、文庫制備、測(cè)序、分析和報(bào)告生成的步驟。

該檢測(cè)利用了公開可用的 ARTIC 多重 PCR 協(xié)議的修改版本，其中 98 個(gè)擴(kuò)增子旨在擴(kuò)增 SARS-CoV-2 病毒特異性序列，并結(jié)合經(jīng)過驗(yàn)證的 Illumina 測(cè)序技術(shù)。PCR 步驟中 63°C 的退火溫度改善了變異分析——提供了對(duì)樣本中存在的 SARS-CoV-2 毒株的重要洞察。

還提供可選的引物池。它基于 ARTIC community v4 設(shè)計(jì)，包括 99 個(gè)擴(kuò)增子，沒有人工控制。試劑盒體積足以容納 384 個(gè)樣品。

將共識(shí)序列信息（FASTA 文件）上傳到開放軟件工具中，以分配譜系和注釋突變。為了更加方便，請(qǐng)直接通過 BaseSpace Sequencing Hub 將文件上傳到 NCBI 和/或 GISAID 應(yīng)用程序。

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